学术无价,科研无假。新年以来,QY球友会文献捷报频传,小编从中挑选了《Cancer Reserch》新鲜出炉的一篇 miRNA QY球友会相关的文章,与大家分享。
miRNA 研究持续高热,然而 mirRNA 对线粒体基因组调控的研究却鲜有报道。中山大学孙逸仙纪念医院李劲松课题组,在舌鳞状细胞癌(TSCC)耐药细胞株中,筛选出了特异高表达的 mitomiR-2392。miR-2392 能够抑制氧化磷酸化(OXPHOS),激活糖酵解作用,从而重新编码代谢过程。并且,miR-2392 调控线粒体基因表达影响了 TSCC 患者的化疗敏感性和总生存率。相关 miRNA 芯片服务由QY球友会提供。
研究思路
研究结果
1.miRNA 芯片筛选 TSCC 耐药细胞株中线粒体特异高表达的 miRNA。
通过 miRNA 芯片实验,TSCC 化疗耐药细胞株中线粒体特异高表达的 11 个候选 miRNA, 其中,表达差异显著的是 miR-2392。通过分析多种癌症的 GEO 数据,发现 miR-2392 的表达均有显著升高的趋势。
2.mitomiR-2392 抑制线粒体基因转录,影响线粒体氧化磷酸化
mtDNA 长约为 16.6 kb,负责编码 OXPHOS 通路的 13 个主要亚基,其中,12 个线粒体基因是从 H 链转录 [1],只有 ND6 从 L 链转录 [2]。考虑到 miR-2392 高表达的细胞中,线粒体主要复合物以及 ATP 水平都显著降低,miR-2392 可能也会通过部分碱基配对影响线粒体基因组的表达。
不同于核基因,线粒体基因组存在较高频率的变异,而生信分析表明,线粒体 H 链上存在与 miR-2392 结合的高度保守区域。进一步的实验结果表明,miR-2392 对线粒体基因的表达的调控作用,需要保守的 5’端结构维持。
3.miR-2392 调控线粒体基因组表达的模型
在特定的细胞条件 [3-5],细胞质中的 miRNA 抑制转录,需要结合 RNA 转录抑制复合物(RISC)[6,7],AGO2 蛋白是转录抑制复合体的重要成员,AGO2-miRNA 已被证明在 TSCC 细胞模型中能够抑制核基因的表达。Rip-seq 和 Co-IP 实验证实了 AGO2 和 miR-2392 的结合作用,从而揭示了 miR-2392 调控线粒体基因组表达的可能机制:AGO2 的协同作用下,mitomiR-2392 识别 H 链中的靶序列,部分抑制多顺子 mtDNA 转录。回顾性研究也验证了,TSCC 患者的化疗敏感性和总生存率与 miR-2392 参与的线粒体基因表达数据之间存在显著相关性。
参考文献
1.Bonawitz ND, Clayton DA, Shadel GS. Initiation and beyond: multiple functions of the human mitochondrial transcription machinery. Mol Cell. 2006;24:813-25.
2. Asin-Cayuela J, Gustafsson CM. Mitochondrial transcription and its regulation in mammalian cells. Trends Biochem Sci. 2007;32:111-7.
3. Sepramaniam S, Ying LK, Armugam A, Wintour EM, Jeyaseelan K.MicroRNA-130a represses transcriptional activity of aquaporin 4 M1 promoter. J Biol Chem. 2012;287:12006-15.
4. Kim DH, Saetrom P, Snove O, Jr., Rossi JJ. MicroRNA-directed transcriptional gene silencing in mammalian cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008;105:16230-5.
5. Younger ST, Corey DR. Transcriptional gene silencing in mammalian cells by miRNA mimics that target gene promoters. Nucleic Acids Res. 2011;39:5682-91.
6. Carthew RW, Sontheimer EJ. Origins and Mechanisms of miRNAs and siRNAs.Cell. 2009;136:642-55.
7. Chekulaeva M, Filipowicz W. Mechanisms of miRNA-mediated post-transcriptional regulation in animal cells. Curr Opin Cell Biol. 2009;21:452-60.
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