935K 甲基化芯片(Infinium Methylation EPIC v2.0 BeadChip)是一种全基因组甲基化筛选工具,靶向人类甲基化组最具生物学意义的区域中超过 935,000 个 CpG 位点,同时在其前代产品 Methylation EPIC v1.0(850K)的基础上极大的提高了向后兼容性。该芯片保留了以单核苷酸分辨率定量分析全基因组 CpG 的能力,同时提供高度准确和精确的甲基化测量,不受测序深度的影响。可使用精简、用户友好的 Infinium 甲基化检测分析多种 DNA 样本类型,包括从 FFPE 分离的 DNA 样本。与其他方法相比,Methylation EPIC v2.0 具有可扩展性和更低的单个样本总成本,因此可用于探究疾病机制和生物标志物的筛选。
活动福利
项目周期: 自 DNA 质控合格后标准生信分析结果发送 10 个工作日;
交付结果: 标准生信分析报告和原始数据;
DNA 要求: 常规 DNA 总量≥1ug,浓度≥50ng/μl,OD260/280 在 1.8 左右;不得有其它个体或其它物种的 DNA 或 RNA 污染;溶解在 H20 或 TE (pH 8.0),特殊样本视具体情况实验。
活动时间:2024 年 2 月 18 日至 2024 年 5 月 31 日
活动说明:
1、合同双方签订完成时间必须在活动时间内;
2、单次送样数目为 8 的倍数;
3、活动最终解释权归QY球友会生物所有。
935K 芯片优势
935K 与 850K 芯片数据相关性
935K 甲基化芯片检测能够检测到 0.2 的 beta 值差异,假阳性率低于 1%,从而实现了较高的分析灵敏度,同时也具有极好的数据可重现性。
如下图:
(A)935K 芯片技术重复相关性 R 2>0.99;
(B)935K 芯片和 850K 的交集探针间的相关性 R 2>0.99;
(C)935K 芯片数据与甲基化测序(100X 测序深度)的相关性 R 2>96%。
935K 芯片实测数据展示
严格按照 Illumina Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip(简称 935K)操作手册完成 DNA 抽提、转化、扩增、杂交洗脱等,质控结果说明杂交实验过程稳定、转化率高、荧光信号和结合状况良好,综合说明实验操作稳定,可以进一步做甲基化的数据分析。