培训时间：2024 年 7 月 10-17 日
培训地点：5206 会议室
培训人员：全体科研工作者
培训内容：2024 QY球友会时空组学前沿技术系列培训班
主办单位：上海QY球友会生物技术有限公司 / 上海QY球友会生物技术有限公司企业科协
指导单位：浦东新区科协
议程表
7 月 10 日 | 单细胞、空转、质控技术介绍 | 单细胞技术、空间转录组技术讲解和应用 |
Agilent2100、4200 的原理及上机演示 | ||
7 月 11 日 | R 语言概念及基础知识·数据简单操作 | R,Rstudio 安装，R 基础，R 包安装 |
7 月 12 日 | 单细胞基础分析 | 单细胞 Seurat 分析流程（Seurat 介绍和安装，单细胞数据载入和质控过滤，数据标准化和归一化，去批次和降维聚类，marker 基因鉴定） |
细胞类型注释 | singleR 细胞类型注释，SCINA 半监督细胞类型注释 | |
7 月 13 日 | 数据可视化 | Seurat 中的数据可视化，基于 Seurat 对象使用 ShinyCell 自动化生成网页报告 Spatialfeatureplot、SpatialDimPlot、选取特定样本 |
7 月 14 日 | 单细胞高级分析 | monocle2 拟时序分析，cellchat 细胞通讯分析 |
SCENIC 单细胞转录因子分析，GSVA 基因集变异分析 | ||
7 月 15 日 | 空间转录组基础分析 | 数据标准化和归一化，数据批次矫正和降维聚类 |
7 月 16 日 | 云生信 | 单组胞云流程（使用、注意事项、参数调整等） 生信小工具（作图工具、单细胞数据分析小工具） |
7 月 17 日 | 空转高级分析 | 空间转录组细胞类型映射：RCTD，CELLTREK，MIA |
切片上展示细胞互作 -stlearn | ||
空间 CNV 分析 -siCNV | ||
hdwgcna: 空间转录组 WGCNA 分析 | ||
肿瘤免疫浸润分析：xcell&cibersort |
培训讲师介绍
侯睿
QY球友会生物 CTO
中国医药生物技术协会基因检测分会青年委员。毕业于中国海洋大学遗传学专业，曾参与多项国家“863”计划项目和国家自然科学基金项目，发表 SCI 论文 8 篇。在基因组学、生物信息学领域经过 10 多年的专业积累，精通高二代测序和基因芯片技术的应用及数据分析，具有丰富项目经验。
张志鹏
博士 QY球友会生物项目拓展经理
参与 CRISPR 诊断相关课题设计及专利申请 10 余项，具有 IVD 和 LDT 产品开发及市场策划经验；擅长单细胞多组学和空间转录组测序数据分析挖掘；参与发表 SCI 论文 6 篇（其中第一作者 2 篇）。
赵莹
上海QY球友会生物技术有限公司实验室总监
毕业于清华大学，曾参与多项国家“863”计划项目和国家自然科学基金项目，发表论文 3 篇，授权发明专利 4 项。在基因组学、细胞生物学等领域有 10 年的专业积累，对样本处理、二代测序、时空组学技术等生物学技术有着丰富的项目经验。
孟宪欣
高级工程师 上海QY球友会生物技术有限公司产品中心副总经理
毕业于辽宁师范大学，曾参加多项国家科技部“863”项目、国家自然科学基金项目和上海市科委项目，发表论文 8 篇，发明专利 1 项。在科技产品研发上有丰富的经验，带领团队开发了 20 余种产品，涉及样本保存、提取，外泌体分离，单细胞核分离，微量样本扩增，甲基化检测等方面。
车王
QY球友会生物产品经理
毕业于日本广岛大学分子细胞情报学专业。对于研究分子，细胞相关的各类仪器和技术方法都有深入的了解。目前于QY球友会生物担任单细胞测序相关仪器试剂的产品经理一职。
王亮
QY球友会生物产品线总监
毕业于华中农业大学，曾参与多项国家“863”计划项目和国家自然科学基金项目，发表论文 3 篇，其中包括参与瑞金医院的研究项目，成果发表在 brain（IF>11）上，杨树空间转录组研究项目，成果发表在 Molecular Plant（IF=27.5）。在基因组学、生物信息学领域经过 7 年的专业积累，精通高二代测序和基因芯片技术的应用及数据分析，在非编码 RNA 的功能、单细胞测序、空间转录组学大数据挖掘等方向有丰富的项目经验。
董美辰
上海QY球友会产品经理
主要负责 Olink 蛋白组学以及空间转录组学相关技术的应用与支持工作。曾参与多项国家自然科学基金项目，具有丰富的实验端经验及多项研究的数据分析经验，擅长单组学及多组学联合应用方向的数据挖掘与方案设计。
张玉娟
QY球友会生物产品经理
毕业于华中农业大学，从事基础医学相关研究，曾参与多项国家自然科学基金项目，熟悉基础科研热点，具有丰富的 SCI 思路设计及数据分析经验。擅长单细胞转录组及多组学联合应用方向的方案设计与数据挖掘。
李宁
QY球友会生物产品经理
毕业于同济大学，在基因组测序、基因芯片领域 8 年多的积累，精通二代测序和基因芯片技术的应用及分析，协助客户进行方案设计与数据分析，肿瘤、遗传病等相关项目经验丰富。
王 昭
上海QY球友会生物技术有限公司技术支持经理
东北农业大学细胞生物学专业，曾任职复旦大学附属中山医院；主要负责课题：肝癌的靶向治疗；放疗联合免疫治疗对肝癌的治疗效果评价，熟练掌握各种基础研究手段。参与国家“863”项目：“动物转基因删除技术与育种应用研究”，参与国家“863”项目子课题：“转录因子介入的转基因克隆动物研究”，参与完成国家自然科学基金，发表多篇 sci 论文，累计影响因子 IF>30，具备基础的研发能力及技术手段。
